Anticorpo policlonale di coniglio anti-DDX21 per WB, IHC-P, IF/ICC, ELISA - Q9NR30

Specifiche e parametri principali del prodotto

Contesto biologico: Funzione e localizzazione di DDX21

• DDX21, noto anche come RNA elicasi nucleolare 2, Gu-alpha e proteina DEAD box 21, è un membro della famiglia delle RNA elicasi DEAD-box, con un peso molecolare stimato di ~87 kDa (UniProt: Q9NR30).
• Nel nucleolo, DDX21 si localizza sui loci del DNA ribosomiale e lega direttamente gli rRNA e gli RNA nucleolari piccoli (snoRNA), promuovendo la trascrizione, il processamento e la 2'-O-metilazione dell'rRNA facilitando il reclutamento dei snoRNA. Riferimenti correlati: PMID:25470060 , PMID:25477391
• Nel nucleoplasma, DDX21 lega l'RNA 7SK e viene reclutato sui promotori genici trascritti dalla RNA polimerasi II, dove facilita il rilascio di P-TEFb dal complesso inibitorio 7SK snRNP in modo dipendente dall'attività elicasi, aumentando così la trascrizione. Riferimenti correlati: PMID:25470060
• DDX21 agisce come cofattore trascrizionale per JUN, ed è necessario per la fosforilazione di JUN nel residuo Ser-77. Riferimenti correlati: PMID:11823437 , PMID:25260534
• La proteina possiede attività di RNA elicasi dipendente da ATP (sbizzarimento dell'RNA a doppio filamento) e attività di RNA foldasi (introduzione di strutture secondarie nell'RNA a singolo filamento). Riferimenti correlati: PMID:9461305
• La deacetilazione mediata da SIRT7 attiva la funzione elicasi di DDX21, permettendogli di superare l'arresto della RNA polimerasi mediato da R-loop e prevenire il danno del DNA associato alla trascrizione. Riferimenti correlati: PMID:28790157
• DDX21 è un componente di un complesso citoplasmatico multi-elicasi–TICAM1 che rileva l'RNA a doppio filamento virale, contribuendo all'immunità innata antivirale.
• Subcellolarmente, DDX21 è prevalentemente nucleolare e nucleoplasmatico, ma può anche localizzarsi nel citoplasma, nel citosol e nei mitocondri in determinate condizioni.

Indicazioni sperimentali e consigli tecnici

• L'immunogeno comprende gli amminoacidi 1–180 vicino all'N-termino di DDX21. Trattandosi di un anticorpo policlonale di coniglio generato contro una proteina di fusione ricombinante, può riconoscere più epitopi all'interno di questa regione.
• Per il western blot (WB) in condizioni denaturanti, ci si aspetta una banda corrispondente alla proteina full-length di circa 87 kDa. Come controllo positivo devono essere utilizzati lisati di linee cellulari umane o murine con espressione confermata di DDX21.
• La prevalente localizzazione nucleolare e nucleoplasmatica di DDX21 lo rende adatto per immunofluorescenza (IF/ICC) e immunoistochimica (IHC-P). Si può osservare un arricchimento nucleare e una colorazione puntiforme nel nucleolo; si consiglia di includere marcatori di organelli appropriati per la verifica.
• Data la natura a legame con RNA e a dominio multiplo di DDX21, le prestazioni dell'anticorpo possono variare in base ai protocolli di fissazione, permeabilizzazione e recupero dell'antigene. È consigliabile ottimizzare questi parametri per il tipo specifico di cellula o tessuto.
• Per applicazioni ELISA, l'anticorpo può essere utilizzato come reagente di cattura o di rilevazione dopo una titolazione standard per determinare le concentrazioni di lavoro ottimali.

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